共聚焦顯微鏡的共聚焦成像能有效抑制焦平面外的雜散光和非測量光進(jìn)入探測器，實(shí)現(xiàn)單一焦層面成像，使分辨率大為提高。載物臺沿橫向均勻移動時(shí)，可形成清晰的單層圖像，沿縱向移動，可實(shí)現(xiàn)樣品不同深度的逐層掃描，經(jīng)過三維重建得到樣品的三維立體結(jié)構(gòu)，即所謂的“光學(xué)CT"。使用熒光探針對樣品進(jìn)行標(biāo)記后再運(yùn)用共聚焦顯微鏡觀測，不僅可觀察固定的各種細(xì)胞和組織結(jié)構(gòu)，還可對活細(xì)胞的形態(tài)、結(jié)構(gòu)、離子等進(jìn)行定性定量定時(shí)觀察及測定。

　　傳統(tǒng)的光學(xué)顯微鏡使用的是場光源，標(biāo)本上每一點(diǎn)的圖像都會受到鄰近點(diǎn)的衍射或散射光的干擾。而共聚焦顯微鏡則在熒光顯微鏡成像基礎(chǔ)上利用激光作為光源，采用共軛聚焦裝置，并利用計(jì)算機(jī)對所觀察分析對象進(jìn)行數(shù)字圖像處理的一套觀察和分析系統(tǒng)。

　　共聚焦顯微鏡與傳統(tǒng)顯微鏡相比，具有高分辨率、高靈敏度、高放大率等特點(diǎn)。隨著軟件開發(fā)和應(yīng)用技術(shù)的完善，共聚焦顯微鏡已成為形態(tài)學(xué)、分子細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、藥理學(xué)、遺傳學(xué)等領(lǐng)域中新一代強(qiáng)有力的研究工具。